于溪

基本信息

学历：博士

出生年月：1988.10

政治面貌：中共党员

邮箱：xyu@shou.edu.cn

目前就职于上海海洋大学，研究员，入选上海市海外青年高层次人才计划，上海市青年东方学者，上海市青年科技英才扬帆计划项目获得者。德国精英大学卡尔斯鲁厄理工学院博士后。南开大学、耶鲁大学联合培养博士。主要进行分子生物学、细胞生物学以及生物化学多学科交叉的相关研究。主持国家自然科学基金项目、上海市科委地方高校能力建设项目各一项。作为项目骨干成员参与“欧洲地平线计划（EU-Horizon 2020）”项目1项、美国国家卫生研究院（NIH）项目2项、中国“863”/“973”国家重点科研项目2项；在Nature Communications、Advanced Materials、Microbiological Research、Frontiers in Microbiology、PloS Genetics等国际知名杂志发表多篇SCI检索论文，一作单篇最高影响因子30.8；美国国家发明专利1项，中国国家发明专利1项；参加国际国内学术会议8次，邀请组织外专报告2次。国际微生物学领域学术期刊“Frontiers in Fungal Biology”编委会成员。长期担任多种mSphere、Scientific Reports、Fungal Biology等国际学术期刊审稿人。德国普通微生物学和应用微生物学学会会员(VAAM)。旅德华人化学化工学会（GCCCD）会员。

教育/工作

2024-今上海海洋大学 海洋科学与生态环境学院 研究员

2020-2024 上海海洋大学 海洋科学学院 研究员

2017-2020 卡尔斯鲁厄理工（KIT） 微生物学博士后-课题组长

2015-2016 耶鲁大学（Yale） 医学院Research associate

2011-2016 南开大学 微生物学 理学博士

2007-2011 西北农林科技大学 制药工程工学学士

研究内容

主要从事极端环境微生物天然产物与生命过程的研究:

1. 查明极端环境下的特殊生物资源。建立深渊模式真菌菌株的研究方法，开发特有深渊真菌天然产物资源，并解析压力变化对次级代谢的调控机理。

2. 探索极端环境下宏生物和微生物（南极鱼-肠道微生物，深渊钩虾-肠道微生物）、环境-生物的相互作用和共同演化过程。

3. 微生物来源的天然产物的独特合成途径、代谢调控及与生存环境相互关系、独特生物活性与作用机制。

科研项目

1.      国家自然科学基金，青年科学基金项目，深渊真菌的次级代谢产物合成及其高压适应调控机制研究，2021-01至2023-12，24万元，在研，主持

2.      上海市科学技术委员会，上海市地方院校能力建设专项,深渊微生物天然产物资源挖掘与药用潜力评估，2020-10至2023-09，100万元，在研，主持

3.      上海市教育委员会，上海市青年东方学者，2020-01至2022-12，60万元，在研，主持

4.      上海市科学技术委员会，上海市青年科技英才扬帆计划项目，2020-07至2023-04，20万元，在研，主持

5.      上海市教育委员会，前沿科学研究基地，深渊生物生命过程研究和资源应用潜力评价专题研究计划，2021-08至2025-07，在研，负责300万

6.      欧洲委员会，地平线计划（EU-Horizon 2020）项目，646178，Nanomaterials for conservation of European architectural heritage developed by research on characteristic lithotypes，2015.06-2018.05，€474,750（363.7万元），已结题，参加

7.      美国国立卫生研究院（NIH），研究项目（R01），NS095817，Systemic gene therapy for glioblastoma，2016.04-2021.03，$327,797（223.8万元），在研，参加

8.      美国国立卫生研究院（NIH），探索与发展基金（R21），NS095147，MIF20-loaded nanoparticles for TBI treatment，2016.03-2018.02，$209,375（142.9万元），已结题，参加

科研成果

已发表期刊论文:

1.        Yu, X., Hu, X., Pop, M., Kirschhöfer, F., Brenner-Weiß, G., Schäfer, J., Bunzel, M. & Fischer R. 2021. Fatal attraction of Caenorhabditis elegans to predatory fungi through 6-methyl salicylic acid. Nature Communications, 12, 5462

2.        Peng, Q., Li, Y., Deng, L., Fang, J., and Yu, X., 2021. High hydrostatic pressure shapes the development and production of secondary metabolites of Mariana Trench sediment fungi. Scientific Reports, 11, 11436

3.        Yu, X., Gou, X., Wu, P., Han, L., Tian, D., Du, F., Chen, Z., Liu, F., Deng, G., Chen, A.T. and Ma, C. and Zhou J., et.al., 2018. Activatable Protein Nanoparticles for Targeted Delivery of Therapeutic Peptides. Advanced Materials. 30, 1705383

4.        Yu, X., Liu, H., Niu, X., Akhberdi, O., Wei, D., Wang, D. and Zhu, X., 2017. The Gα1-cAMP signaling pathway controls conidiation, development and secondary metabolism in the taxol-producing fungus Pestalotiopsis microspora. Microbiological Research, 203, 29-39

5.        Yu, X., Huo, L., Liu, H., Chen, L., Wang, Y. and Zhu, X., 2015. Melanin is required for the formation of the multi-cellular conidia in the endophytic fungus Pestalotiopsis microspora. Microbiological Research, 179, 1-11

6.        Yu, X., Wang, Y., Pan, J., Wei, D. and Zhu, X., 2015. High frequency of homologous gene disruption by single-stranded DNA in the taxol-producing fungus Pestalotiopsis microspora. Annals of microbiology, 65(4), 2151-2160

7.        Youssar, L., Wernet, V., Hensel, N., Yu, X., Hildebrand, H.-G., Schreckenberger, B., Hetzer, B. & Fischer, R. 2019. Intercellular communication is required for trap formation in the nematode-trapping fungus Duddingtonia flagrans. PLoS Genet., 15(3), e1008029

8.        Liu, Y., Chen, L., Xie, Q., Yu, X., Duan, A., Lin, Y., ... & Zhu, X. 2019. A gene cluster for the biosynthesis of dibenzodioxocinons in the endophyte Pestalotiopsis microspora, a taxol producer. Journal of microbiology and biotechnology. 29(10): 1570-1579

9.        Hu, Y., Hao, X., Chen, L., Akhberdi, O., Yu, X., Liu, Y. and Zhu, X., 2018. Gα-cAMP/PKA pathway positively regulates pigmentation, chaetoglobosin A biosynthesis and sexual development in Chaetomium globosum. PloS one, 13(4), e0195553

10.    Akhberdi, O., Zhang, Q., Wang, H.,…Yu, X., Wei, D. and Zhu, X., 2018. Roles of phospholipid methyltransferases in pycnidia development, stress tolerance and secondary metabolism in the taxol-producing fungus Pestalotiopsis microspore. Microbiological research, 210, 33-42

11.    Wang, D., Akhberdi, O., Hao, X., Yu, X., Chen, L., Liu, Y. and Zhu, X., 2017. Amino Acid Sensor Kinase Gcn2 Is Required for Conidiation, Secondary Metabolism, and Cell Wall Integrity in the Taxol-Producer Pestalotiopsis microspora. Frontiers in Microbiology, 8, 1879

12.    Zhang, Q., Chen, L., Yu, X., Liu, H., Akhberdi, O., Pan, J. and Zhu, X., 2016. AB‐type histone acetyltransferase Hat1 regulates secondary metabolism, conidiation, and cell wall integrity in the taxol‐producing fungus Pestalotiopsis microspora. Journal of basic microbiology, 56(12), 1380-1391

13.    Chen, L., Wei, D., Zhang, Q., Yu, X., Wang, Y. and Zhu, X., 2015. Orotidine 5′‐phosphate decarboxylase‐based reusable in situ genetic editing system: Development and application in taxol‐producing Pestalotiopsis microspora. Engineering in Life Sciences, 15(5), 542-549

14.    Niu, X., Hao, X., Hong, Z., Chen, L., Yu, X. and Zhu, X., 2015. A putative histone deacetylase modulates the biosynthesis of pestalotiollide B and conidiation in Pestalotiopsis microspora.Journal of Microbiology and Biotechnology, 25(5), 579-588

15.    Niu, X., Nan, J., Yu, X., Bi J., Pan, J., Zhu, X. 2014. Decolorization of the Fermentation Broth from a Taxol-producing Fungus B19. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Nankaiensis, 3, 004